Affymetrix Canine Genome 2.0 Array 狗
该芯片可以检测18,000个犬的mRNA/EST转录子，和超过20,000个非冗余的预测基因。
长链非编码RNA芯片
ncRNA研究的重要一步是发现与特定疾病相关的lncRNA。传统的lncRNA筛选方法（SELEX等）效率低下，假阳性率高。而基因芯片具有覆盖全面、高效、准确的特点
Affymetrix Plasmodium/Anopheles Genome Array 疟原虫
该芯片包括约4,300 Plasmodium falciparum 的转录子和约14,900 Anopheles gambiae 转录子。